计算机网络的应用技术和信息安全技术：安全网络技术的研究，已经完成“入侵检测预警和安全管理技术”与“安全网络服务器技术研究”2项国家863计划信息安全主题研究项目，重大国防项目2项，广东省自然科学基金项目3项。基于互联网络的软件工程技术和网络软件集成技术，在多agents协同工作，通用rpc应用平台等方面取得了研究成果。中间件技术，特别是安全中间件在银行支付系统中的应用技术，取得了多个成功应用的案例。j2ee架构的应用技术，在corba应用技术方面也取得了成果。

智能化网络与应用：智能主体（agent）及其应用技术：主要研究主体语言、主体之间的协作和协调、通信和交互技术、多主体学习以及多主体系统在基因组自动注释（automated genomic annotation）、生物信息智能集成与共享web服务资源融合中的应用等。数据挖掘与知识发现：主要研究基础理论、发现算法、可视化技术、定性定量互换模型、知识表示方法、发现知识的维护和再利用、半结构化和非结构化数据中的知识发现以及网上数据挖掘等。语义web与ontology：研究语义web的支撑技术、模型和方法，包括可扩展标记语言（xml，extensible markup language）、xml schemas、资源描述框架（rdf， resource description framework）和知识本体（ontology）等创建语义web的支撑技术。重点研究：设计机器可读的网上信息内容表示、自动推理模式、后基因组语义web的支撑技术、ontology与基因功能注释、知识网格和信息网格。生物信息智能处理技术：研究生物智能信息处理中的算法问题，重点研究生物信息资源共享技术和生物信息的知识挖掘。主要包括研究新的dna序列特征分析方法；研究先进、高效的信息分析和数据挖掘手段，从大量繁杂的蛋白质组数据中找出内在联系，揭示蛋白质的功能及相互作用关系。